Die IBK versteht sich als politisches Dach der grenzüberschreitenden Zusammenarbeit in der Bodenseeregion. Die zehn Mitgliedsländer und -Kantone wollen die Innovationskraft der Bodenseeregion als zukunftsfähigem Wirtschafts-, Wissenschafts- und Lebensraum stärken und die Potenziale der Digitalisierung nutzen, in dem die regionalen Wissenschafts- und Innovationssysteme sowie Cluster noch besser vernetzt werden.